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其中A類硅膠帶負電荷的殘留硅羥基，而且酸性表面上金屬含量高(硅羥基的pKa低)，從而導致堿性化合物較易發生拖尾。

而B類硅膠由于金屬含量低，硅羥基pKa高，堿性化合物不易發生拖尾。

而自1990以后用來制作色譜柱固定相填料的硅膠顆粒已經全部采用B型硅膠。

事實上針對硅膠表面的金屬離子，供應商最有效的方案是進行酸洗。

有案例顯示硅膠在化學改性前如用強酸處理，可以去除高達1/3的金屬離子雜質。