一、按應用場所分類
純水機分為生活飲用型純水機和實驗室用純水機(也叫超純水機)。
家用純水機采用的主要是反滲透膜技術。純水機的工作原理是對水施加一定的壓力，使水分子和離子態的礦物質元素通過反滲透膜，而溶解在水中的絕大部分無機鹽(包括重金屬)，有機物以及細菌、病毒等無法透過反滲透膜，從而使滲透過的純凈水和無法滲透過的濃縮水嚴格的分開；反滲透膜上的孔徑只有0.0001微米，而病毒的直徑一般有0.02微米。
二、根據使用情況分類
純水機根據使用情況分為手動型(也稱經濟型)和自動型。兩者的不同點只是在于純水機的反沖洗方面，經濟型的純水機使用的是手動反沖洗閥門。
三、根據使用特點分類
分為櫥上型和櫥下型。
四、其他分類
純水機還可分為分體式和一體式。分體式的占地面積比較大，儲水桶和機身分離；一體式純水機的主機和儲水桶在一起，占地面積小，外形美觀大方。用戶可根據自己的實際情況選擇適合自己的純水機。
